Это название отгороженного места в амбаре образовано от глагола закромити (кромити) – "(от)городить". Кромити возникло на основе существительного крома – "край". Родственные слова: кромка, укромный.
Этимологический словарь русского языка. — СПб.: ООО "Виктория плюс". Крылов Г. А.. 2004.