Это название минерала является заимствованием из французского, где calcedoine восходит к латинскому calcidonius от греческого географического названия Chalkedon в Малой Азии, богатой этим минералом.
Этимологический словарь русского языка. — СПб.: ООО "Виктория плюс". Крылов Г. А.. 2004.