Это название сборщика податей, таможенника было заимствовано из древненемецкого, где mutari – "мытарь" образовано от muta – "пошлина, подать". Первоначальное значение – "брать пошлину" было переосмыслено в "обманывать, обсчитывать".
Этимологический словарь русского языка. — СПб.: ООО "Виктория плюс". Крылов Г. А.. 2004.