Заимствование из французского, где niche образовано от глагола nicher "делать гнездо", родственного латинскому nidus – "гнездо". Отметим родство латинского слова, а следовательно, и французского русскому гнездо.
Этимологический словарь русского языка. — СПб.: ООО "Виктория плюс". Крылов Г. А.. 2004.