Это название капитана на коммерческом судне является заимствованием из голландского, где schipper – образовано от schip – "корабль, судно".
Этимологический словарь русского языка. — СПб.: ООО "Виктория плюс". Крылов Г. А.. 2004.
Этимологический словарь русского языка. — СПб.: ООО "Виктория плюс". Крылов Г. А.. 2004.